Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYSND1Q2T9J0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TYSND1Q2T9J0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms