Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB5Q2M3G0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB5Q2M3G0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB5Q2M3G0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB5Q2M3G0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB5Q2M3G0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB5Q2M3G0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCB5Q2M3G0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB5Q2M3G0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCB5Q2M3G0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms