Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ECM1Q16610 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM1Q16610 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM1Q16610 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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