Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF239Q16600 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms