Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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TAF9Q16594 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TAF9Q16594 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TAF9Q16594 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TAF9Q16594 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TAF9Q16594 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF9Q16594 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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