Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNAPC1Q16533 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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SNAPC1Q16533 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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SNAPC1Q16533 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNAPC1Q16533 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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