Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB11BQ15907 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB11BQ15907 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms