Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRRQ15256 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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PTPRRQ15256 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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PTPRRQ15256 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRRQ15256 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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