Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK3Q15120 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDK3Q15120 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK3Q15120 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK3Q15120 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK3Q15120 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK3Q15120 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK3Q15120 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms