Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERPUD1Q15011 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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