Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE3AQ14432 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE3AQ14432 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE3AQ14432 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms