Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKP1Q13835 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
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