Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIPK1Q13546 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPK1Q13546 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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