Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MTA1Q13330 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA1Q13330 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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