Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT88Q13099 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT88Q13099 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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