Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXI1Q12951 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXI1Q12951 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms