Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH17Q12864 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH17Q12864 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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