Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCB1Q12824 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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