Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD47Q08722 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD47Q08722 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD47Q08722 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD47Q08722 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD47Q08722 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD47Q08722 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD47Q08722 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD47Q08722 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD47Q08722 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD47Q08722 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD47Q08722 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD47Q08722 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD47Q08722 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD47Q08722 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD47Q08722 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD47Q08722 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms