Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD300CQ08708 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms