Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP3CAQ08209 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP3CAQ08209 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP3CAQ08209 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms