Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGM3Q08188 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGM3Q08188 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms