Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL18Q07020 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms