Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK18Q07002 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms