Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
APLP2Q06481 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
APLP2Q06481 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
APLP2Q06481 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
APLP2Q06481 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
APLP2Q06481 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
APLP2Q06481 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms