Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT17Q04695 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms