Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
ERCC6Q03468 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ERCC6Q03468 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ERCC6Q03468 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms