Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP4A11Q02928 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4A11Q02928 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4A11Q02928 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms