Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TOP2BQ02880 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOP2BQ02880 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.2 ms