Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB1Q02818 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB1Q02818 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUCB1Q02818 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms