Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SP4Q02446 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SP4Q02446 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP4Q02446 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP4Q02446 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP4Q02446 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP4Q02446 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP4Q02446 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP4Q02446 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP4Q02446 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP4Q02446 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SP4Q02446 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP4Q02446 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP4Q02446 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP4Q02446 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP4Q02446 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SP4Q02446 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP4Q02446 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP4Q02446 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP4Q02446 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP4Q02446 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP4Q02446 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms