Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPIBQ01892 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIBQ01892 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms