Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1BQ00975 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms