Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAE1P78406 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAE1P78406 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAE1P78406 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAE1P78406 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAE1P78406 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAE1P78406 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAE1P78406 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAE1P78406 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAE1P78406 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAE1P78406 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAE1P78406 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAE1P78406 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAE1P78406 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAE1P78406 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAE1P78406 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms