Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN10P78369 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN10P78369 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms