Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERVK_113P63132 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P63132 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P63132 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms