Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113P63121 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113P63121 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms