Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCDC1P59894 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC1P59894 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC1P59894 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms