Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMTNP53814 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMTNP53814 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMTNP53814 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMTNP53814 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMTNP53814 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMTNP53814 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMTNP53814 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMTNP53814 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMTNP53814 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMTNP53814 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMTNP53814 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMTNP53814 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMTNP53814 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms