Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUBP1P53384 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUBP1P53384 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms