Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAV2P52735 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV2P52735 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV2P52735 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV2P52735 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV2P52735 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV2P52735 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV2P52735 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV2P52735 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV2P52735 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV2P52735 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV2P52735 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV2P52735 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV2P52735 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV2P52735 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms