Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK3P51956 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK3P51956 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK3P51956 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK3P51956 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK3P51956 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEK3P51956 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK3P51956 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK3P51956 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK3P51956 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK3P51956 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK3P51956 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK3P51956 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK3P51956 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK3P51956 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK3P51956 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEK3P51956 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEK3P51956 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEK3P51956 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK3P51956 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK3P51956 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK3P51956 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK3P51956 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEK3P51956 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms