Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNHP51946 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNHP51946 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNHP51946 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNHP51946 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNHP51946 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNHP51946 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNHP51946 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNHP51946 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNHP51946 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNHP51946 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNHP51946 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNHP51946 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNHP51946 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNHP51946 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNHP51946 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNHP51946 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNHP51946 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNHP51946 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNHP51946 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNHP51946 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNHP51946 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNHP51946 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNHP51946 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNHP51946 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms