Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1GP51170 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1GP51170 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms