Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RARRES1P49788 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES1P49788 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms