Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNTAP49354 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNTAP49354 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FNTAP49354 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNTAP49354 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTAP49354 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTAP49354 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTAP49354 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNTAP49354 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNTAP49354 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNTAP49354 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNTAP49354 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTAP49354 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTAP49354 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTAP49354 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTAP49354 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTAP49354 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTAP49354 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNTAP49354 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNTAP49354 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTAP49354 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTAP49354 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTAP49354 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTAP49354 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTAP49354 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNTAP49354 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNTAP49354 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNTAP49354 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNTAP49354 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms