Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ME1P48163 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ME1P48163 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ME1P48163 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ME1P48163 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ME1P48163 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME1P48163 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME1P48163 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME1P48163 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME1P48163 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME1P48163 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME1P48163 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ME1P48163 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME1P48163 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME1P48163 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ME1P48163 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME1P48163 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME1P48163 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME1P48163 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME1P48163 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ME1P48163 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME1P48163 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ME1P48163 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME1P48163 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME1P48163 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME1P48163 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME1P48163 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME1P48163 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME1P48163 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME1P48163 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME1P48163 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME1P48163 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME1P48163 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME1P48163 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME1P48163 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME1P48163 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME1P48163 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms