Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGRP47804 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGRP47804 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGRP47804 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGRP47804 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGRP47804 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGRP47804 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGRP47804 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGRP47804 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGRP47804 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGRP47804 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGRP47804 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGRP47804 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGRP47804 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGRP47804 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGRP47804 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGRP47804 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGRP47804 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGRP47804 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGRP47804 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGRP47804 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGRP47804 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGRP47804 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGRP47804 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGRP47804 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGRP47804 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGRP47804 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGRP47804 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGRP47804 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGRP47804 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGRP47804 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGRP47804 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGRP47804 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGRP47804 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGRP47804 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGRP47804 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGRP47804 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGRP47804 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGRP47804 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGRP47804 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGRP47804 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGRP47804 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGRP47804 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGRP47804 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RGRP47804 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGRP47804 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms