Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD4P46934 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD4P46934 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEDD4P46934 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4P46934 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms