Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP5P45974 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP5P45974 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP5P45974 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP5P45974 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP5P45974 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP5P45974 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP5P45974 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP5P45974 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP5P45974 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP5P45974 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP5P45974 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP5P45974 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP5P45974 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP5P45974 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP5P45974 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP5P45974 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP5P45974 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP5P45974 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP5P45974 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP5P45974 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP5P45974 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP5P45974 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP5P45974 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP5P45974 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms